Nasce a Cambridge in Massachusetts nel 1968. La sua infanzia è felice e avventurosa, piena di passeggiate nei boschi e bagni al lago Boon. Il lavoro del padre porterà la famiglia a trasferirsi in Italia per qualche anno. Matthew ne verrà fortemente colpito, soprattutto dalla vista di paesaggi collinari decorati da rovine e castelli, tanto che lui stesso parlando della sua scrittura dirà di averla sempre immaginata come una costruzione di rovine. Dopo il ritorno negli Stati Uniti, decide da adolescente di voler diventare uno scrittore e comincia a scrivere storie, racconti e fumetti. Si laurea poi all'università di Cambridge in Letteratura Inglese e inizia a lavorare presso la casa editrice Candlewick Press e come critico di musica classica. In quel periodo scrive il suo primo libro Thirsty. Da quel momento in avanti non ha mai smesso di scrivere spaziando dalla letteratura per adulti a quella per bambini e giovani adulti, ricevendo anche numerosi premi: il libro Feed è finalista al National Book Award e vincitore del L.A. Times Book Prize; mentre il primo volume della Octavian Nothing saga vince il National Book Award. Oltre a scrivere, le sue passioni sono la musica classica e i viaggi in paesi esotici.